Em Flow, o mundo parece ter chegado ao fim, coberto por vestígios da presença humana, mas sem ninguém por perto. O gato é um animal solitário que, um dia, enquanto é perseguido por uma manada de cães, vê seu lar ser devastado por uma grande enchente. Buscando sobreviver, ele enfrenta diferentes ameaças, e encontra refúgio em um barco povoado por diversas espécies. Enquanto tentam fugir de toda essa situação hostil, os animais terão que se unir apesar de suas diferenças.